桌台市南面大门前，守护者们率领宝可梦站成一排，慎重地望向远处席卷而来的尘土浪潮。
“大家准备好！……最大火力攻击！”
长官一声令下，城墙上的激光炮与宝可梦们的攻击倾泻而出，硬生生轰出了一片空旷地带。
骚动吸引了大片悖谬宝可梦的注意，一群群朝着大门处冲来，就如同一片由宝可梦组成的浪潮，想要将整个城市吞噬淹没。
然而就在此时，守护者基地的发射台缓缓开启，两道身影出现在电磁轨道上，随着装置启动，二人在轨道上迅速向前移动，并在最后一刻背部的机翼展开，朝着南方飞去。
这二人，正是意外穿越到100年后的小智与阿弘，以回到过去为目标朝着小匙灯塔进发。
得知小匙灯塔有回归的线索后，小智等人立即返回了守护者基地，在众人的帮助下了解了灯塔的各种信息，以及经历100年仍屹立不倒的谜团。
小智二人选择了悖谬宝可梦集体攻向基地的时间段出发，每过两个月宝可梦们都会发起一次总攻，被人们称为“兽潮”。
在等待“兽潮”的三天里，小智与阿弘初步学会了背包飞行器的使用，计划利用飞行器前往废弃的平碟镇，保留宝可梦的实力，来应对平碟镇到小匙灯塔的最后一段“冲刺距离”。
“皮卡丘（雷恩），十万伏特！！”
小智与阿弘异口同声地喊道，戴着护目镜的皮卡丘与雷恩一同跳起，合力使出了十万伏特，强劲的电流将几只准备袭击的铁毒蛾击落。
远远望见城镇的轮廓，二人最后一次看了一眼被群群宝可梦包围的守护者基地，一鼓作气冲向了平碟镇。
“这里就是……平碟镇？”
从一处房顶跃下，阿弘站在街道上四下张望，虽然比穴扎镇更为完整却依然一片死寂，让人感到无助与绝望。
“撒头兮，这边！”
小智被阿弘拉进了一间屋内，两只吼叫尾摇摇晃晃地从门口经过，没有发现异常便慢慢远去。
“吼叫尾，过去宝可梦，妖精与超能属性，超自然杂志曾将某只神秘的宝可梦介绍为10亿年前的胖丁，该宝可梦与它长得很相似。”
“吼叫尾么……这种家伙是怎么出现的？”
小智的洛托姆手机搭载了新的程序，从民居阁楼飞出，小心探查着周围的情况。
二人从另一部手机上查看着传回来的画面，无数的宝可梦穿过街道，朝着桌台市的方向蜂拥而去。
而在平碟镇南方道路上，同样有不少悖谬宝可梦在四下游荡，原本的山丘被撞得四分五裂，然而灯塔似乎存在着一种魔力，让宝可梦们不得不绕道而行，就如同孤岛一般伫立在原地。
“这是克鲁兹吗？已经进化了啊！”
小智抬头看着眼前的班基拉斯赞叹不已，幸好民居足够宽大，能够容纳下其庞大的身躯。
二人坐在中间将宝可梦们放了出来，围在一起将食物消灭，小声商量着逃脱计划……
“上啊！”
死寂的街道上忽然传来一阵叫喊声，接着一扇门飞出，砸在了路过的铁包袱头上。
班基拉斯在平碟镇横冲直撞，很快便冲到了另一侧的出口，愈来愈多的悖谬宝可梦围了上来，被皮卡丘与雷恩合力击退。
趟过河流，班基拉斯明显有些体力不支，将小智和阿弘放下后回到了精灵球中。
“路卡利欧，超绝螺旋连击！！”
小匙灯塔已然出现在视野之中，小智当机立断，与路卡利欧合力使出了钢属性的z招式，随着路卡利欧旋转着直冲向前，十几只宝可梦被击倒在地，小智二人紧跟其后顺利突围。
然而很快，仿佛无穷无尽的悖谬宝可梦再次围拢，一只波荡水猩红的眼眸直直看向小智，似乎发现了梦寐以求的猎物，率先冲来，露出了满嘴的獠牙。
“撒头兮，没时间了，”阿弘喘了口气，看着路卡利欧用子弹拳将波荡水击退，“超进化吧，一口气冲到灯塔下！”
小智与阿弘对视，看到对方亮出了手腕处的超级手环，瞬间明白了他的意思。
“那就来吧～”
“出来吧，喷火龙（吉波）！”
“超进化么，还真是期待啊，喷火龙！”
喷火龙仰头一口火焰喷出，将超进化石紧紧抓在手中，朝着小智点了点头。
“一起上吧，mega～进化~！！”
“吼～！”
两只喷火龙齐齐大吼，无比耀眼的光芒喷涌而出，将钥石与超进化石紧密相连。
小智似乎看到了喷火龙的内心，一张张回忆画面涌上心头，雨中相遇，成为伙伴，一时的不听从命令，激战化石翼龙，急冻鸟……
“到现在，我们好像真的成长了不少呢，喷火龙……”
外部的声音全然消失，一片光芒空间内，小智与小火龙相隔深渊，随着记忆闪过，小火龙变成了火恐龙，摇身一变双翼展开，最终喷火龙出现在小智面前。
越走越近，从一开始的陌生距离到如今的咫尺之间，两道身影踩着羁绊凝聚的浮桥前进，最后紧拥在一起……
“请多指教，喷火龙。”
小智与喷火龙对了对拳，眼前一阵模糊，回到了现实世界。
“上啊，喷火龙！！！”
随着光芒闪过，喷火龙彻底完成了超进化，以全新的姿态出现在天地之间！
双翼伸长，手臂上同样长出了小型翅膀，尾巴上的火焰熊熊燃烧，头部第三只角凸出，眼神中充满了斗志。
“超级喷火龙……Y吗？”
“很好！要上了哦，阿弘！”
“知道了！”
超级喷火龙x与超级喷火龙Y站在二人面前，随着翅膀挥动，无尽狂风让袭来的悖谬宝可梦不由得后退数步。
“龙幽灵地上飞行
毒虫水电岩石………”
一阵歌声响彻云霄，小智会心一笑，在强烈的阳光下倒转帽檐，与阿弘一同冲出！
“喷火龙，喷射～火焰！！“
“喷火龙，闪焰冲锋！！”
（前方就是冒险即使在黑暗之中）
超级喷火龙Y纵身飞向高空，一道炽热火焰席卷空中的铁毒蛾与轰鸣月，下方的超级喷火龙x化作火焰横冲上前，将数只铁包袱吼叫尾击飞！
（像是流星一样毫无犹豫发光吧）
“空气斩！”
“龙爪！”
（拿出勇气走吧战胜昨天的我）
“一给！！！！”（异口同声）
随着一声炸响，几只雄伟牙和铁武者飞向天际，二人快步来到灯塔研究所门前，看着不肯上前的悖谬宝可梦们松了一口气。
“如果心中藏着巨大的梦想……”
“呃，小智？小智！”
研究着进入方式的小智回过神来，看向阿弘。
“撒头兮，已经结束了，把歌关了吧，有点，有点吵……”
小智：………
“钢超能力妖精……嘟～”
小智轻咳数声，将洛托姆手机关闭，随意拉了拉门把手。
“吱嘎……”
皮卡丘：(? ○ Д ○)?
“啊？没有锁门？！”
来不及吐槽，小智与阿弘抓紧进入，为了安全又将一张桌子挡在门口。
“呼……来找线索吧！”
小智活动了下身体，摸索片刻将灯光打开，映入眼帘的是空中悬浮的灰尘，在灯光下散发着若隐若现的光芒。
“咳咳……”
小智咳嗽着上前，目光落在墙上的相框上。
抹去灰尘，露出了一张大合影的照片，画面上的自己与妮莫三人紧紧相拥，背后上张着大嘴的密勒顿与故勒顿，一位陌生的卷发少年站在一旁，表情有些不太自然。
“这是什么时候……”
小智摇了摇头不再理会，墙上一些其他相片没有细看，其中一张是自己捧着冠军奖杯的照片，喷火龙与其他伙伴簇拥着，将一道模糊的黄色身影高高抛起……
“什么嘛，都把皮卡丘拍成这样子了。”
“皮咔……”
“小智，来这边！”
“啊啊啊，皮卡丘快放下！”
皮卡丘手里抓着一个皮卡丘手办不肯放手，任凭小智呲牙咧嘴也不为所动。
“皮咔皮咔。”
“来了！”
小智狠狠瞪了一眼皮卡丘，扭头将一个自己样子的手办塞进口袋里离开……
“小智，这里有个地下室，似乎就在下面。”
合力拉开隔板，瞬间一股极寒气息从下方溢出，让小智二人不由得后退数步，脸上似乎结出了不少冰霜。
看向早已结冰的阶梯，小智与阿弘对视一眼，纵身一跃“滑”了下去……